Tunnistusmerkintänä käytetään Suomessa tatuointia tai mikrosirua. Merkinnän saa koiralle oman paikkakunnan eläinlääkäriltä tai tunnistusmerkitsijäksi koulutetulta henkilöltä. Tunnistusmerkinnästä on hyötyä, jos koira karkaa tai se varastetaan. Merkinnän avulla viranomaiset löytävät koiran omistajan tarvittaessa nopeastikin.

Vastuuntuntoiset kasvattajat ovat tähänkin saakka tunnistusmerkinneet pentunsa jo ennen niiden rekisteröimistä tai viimeistään ennen pennun luovutusta. Tällöin uuden omistajan tehtäväksi jää vain omistajatietojensa ilmoittaminen Kennelliiton omistajarekisteriin.

Tunnistusmerkintä toimii koiran ”henkilötietona” myös koirien terveystarkastuksia tehtäessä. Tutkimukset voidaan tehdä virallisesti vain tunnistusmerkityille koirille, ja niiden tulokset Kennelliitto rekisteröi tilastoihinsa, jotka ovat Kennelliiton internet-sivuilla vapaasti selattavissa.

Jalostukseen käytettävien koirien ja rekisteröitävien pentujen tunnistusmerkintäpakko on jo vaatimuksena useissa kansainvälisen koiranjalostusliiton FCI:n jäsenmaissa, joihin Suomikin kuuluu.